阿联酋迪拜自由贸易区公司和本地公司之间的区别主要体现在以下方面：

业务权限与地域限制：

自由贸易区公司：只能在特定的自由贸易区内或阿联酋境外开展业务，不能直接在阿联酋本土销售产品或提供服务。如果自由贸易区公司希望在阿联酋境内销售其产品，他们必须通过具有大陆许可证的分销商进行销售，并且货物应通过分销商本身运入，否则任何离开自由贸易区的货物将被征收5%的关税。

本地公司：可以在整个阿联酋和国际范围内进行贸易，没有特定的地理区域或自由贸易区的限制。因此，它们特别适合那些希望在迪拜本地市场销售产品或服务的企业。

所有权结构：

自由贸易区公司：可以由外籍人士拥有，不需要阿联酋国民合伙人或当地服务代理。

本地公司：需要在营业执照中列出一名阿联酋国民作为保人，并且该保人需要成为多数股权持有人，至少持有51%的股份，外籍人士Zui多可以持有公司49%的股份。

注册流程与优势：

自由贸易区公司：注册流程通常相对简单，签证申请较容易，并且董事、股东和员工可以申请2年的长期有效签证。然而，它们的业务通常限定在自由贸易区内，如果需要在迪拜本地市场开展业务，可能需要额外的许可。

本地公司：虽然注册流程可能相对复杂，但它们可以在整个阿联酋境内开展业务，没有地域限制。

贸易与金融自由：

自由贸易区公司：享受免税、海外及自由贸易区之间进出和存储自由、海关*检等贸易自由，以及金融开放、利率市场化、汇率自由汇兑等货币流通自由。

本地公司：在这些方面的自由程度可能相对较低，因为它们需要遵守更广泛的阿联酋法律和规定。

总的来说，自由贸易区公司和本地公司在业务权限、地域限制、所有权结构、注册流程、贸易与金融自由等方面存在显著差异。选择哪种类型的公司取决于投资者的具体需求和业务目标。如果主要目标是国际贸易，自由贸易区公司可能更合适；而如果希望在迪拜本地市场开展业务，本地公司可能更合适。